Přístup do IS
Jako nepřihlášený uživatel můžete procházet dokumenty přístupné veřejnosti, vidíte aktuality a v těchto dvou položkách můžete vyhledávat pomocí fulltextového vyhledávání. Další funkce IS můžete využívat až po přihlášení.
Přihlášení
Každý přistupuje do systému pod unikátním uživatelským jménem (=IČO organizace) a heslem. Přihlášení probíhá prostřednictvím přihlašovací stránky. Pokud už jste přihlášeni a chcete pracovat pod jiným přístupem, musíte se nejprve odhlásit a pak teprve je možné se přihlásit jako jiný uživatel.
Registrace
Pokud se se systémem chystáte pracovat poprvé, musíte vaši organizaci registrovat. Při registraci zadáte:
- název organizace (shodný se stanovami nebo zřizovací listinou),
- IČO,
- kontaktní e-mailovou adresu organizace (nikoliv soukromou).
Po registraci vám na zadanou e-mailovou adresu přijde mail s přístupovými údaji.
Profil organizace
Po přihlášení do systému si nejprve vyplňte tzv. profil organizace, na který se dostanete pomocí tlačítka "údaje o organizaci". Tomuto kroku věnujte maximální pozornost, protože data, která zde vyplníte se poté propisují do všech, vámi zadaných, žádostí o dotaci. V případě jakékoliv změny (např. změna adresy organizace, změna bankovního účtu) je nutné data neprodleně aktualizovat. Nezapomeňte v údajích o organizaci doplnit i povinné přílohy. Tyto soubory vkládáte do záložky "Dokumenty organizace".
V "údajích o organizaci" si můžete dále změnit přidělené heslo, což doporučujeme. Heslo musí splňovat bezpečnostní pravidla, která jsou uvedena ve žluté nápovědě k poli.
Pokud heslo zapomenete (ztratíte), můžete využít modul ZAPOMENUTÉ HESLO, který naleznete zde.
Další důležité záložky jsou METODIKA a PROJEKTY.
Projekty
Záložka PROJEKTY slouží pro správu projektů. Pomocí volby "založit projekt" založíte zcela nový projekt. Kolik projektů lze v kterém programu založit, limity pro žádosti apod. najdete v rozcestníku pod jednotlivými skupiny programů, příp. blíže ve vyhlášení jednotlivých programů.
Založenému projektu bude přiděleno evidenční číslo. Projekt bude umístěn v kapitole "Rozpracované projekty". V této fázi je možné projekt editovat. Před uzavřením projektu by měly být všechny části žádosti označeny zelenou fajfkou 
a rozpočet musí být vyrovnaný, tzn. náklady - zdroje = 0. Teprve potom půjde projekt uzavřít. Po uzavření projektu se vygeneruje finální žádost ve formátu PDF, kterou je nutné vytisknout, nechat podepsat stat. orgánem a poslat na adresu, která je uvedena ve vyhlášení konkrétního programu.
Žádost o udělení titulu
Žádost o udělení titulu mohou organizace podávat každý rok. Konkrétní termín pro předkládání žádostí v daném roce je včas uveřejněn na webových stránkách MŠMT. Žádosti se podávají následujícím způsobem:
Do údajů o organizaci, v kapitole dokumenty organizace/Dokumenty organizace k titulu MŠMT uznaná organizace, organizace vloží níže uvedené přílohy:
- vyplněný úvodní list žádosti, formulář ke stažení zde: Úvodní list žádosti o udělení titulu pro NNO.docx,
- popis strategického plánu rozvoje organizace,
- čestné prohlášení žadatele o titul, formulář ke stažení zde: Čestné prohlášení pro žadatele o titul.docx,
- další doklady (důkazy) pro doložení splnění jednotlivých kritérií (tyto doklady je nutné vložit do systému jako jeden soubor, a to ve formátu ZIP)
Vyplněný úvodní list žádosti a čestné prohlášení žadatele o titul se do elektronického systému vkládají podepsané ve formátu PDF.